納米防指紋油的防污本質是在規定的有效期內提供一個沒有污垢附著的涂層表面。可以采用不同的防污原理，但較實用的是使用防指紋劑，有效控制表面附著力，抑制油污附著。這就要求納米防指紋油能夠滿足防指紋劑的可控要求，就是具有穩定有效的防指紋和防手指滲出率。

納米防指紋油防污的物理化學物理方法包括低表面能法和表面植絨法。低表面能法是基于硅和含氟聚合物的低表面能原理和海洋生物附著困難而設計的[敏感詞]種有效方法。表面植絨法是根據海洋生物容易附著在巖石和鋼鐵表面，而不是柔軟的海藻上的觀察而設計的。

細滌綸長絲栽在布上，附著在金屬表面，防止污染。實踐對比證明，防污效果良好。納米電化學防污指紋油是近提出的一種新方法。方法是在金屬表面涂上一層導電的防指紋油，通過弱電流在涂層表面形成一層10μm厚的次氯酸鹽離子層，可以防止油和微生物的粘附作用，對人體無害。

納米級防污指紋油是基于活性蛋白酶能快速分解由蛋白質組成的海洋生物，避免船舶污染的原理。目前正處于試驗階段。納米指紋防污油是一種傳統防污油納米指紋防污方法。化學物質自清潔污垢已經發展成為一種無毒、環保的防污材料。

無毒環保的防污已成為化學納米指紋油的主要防污方法。從化學分子結構上看，生物粘附是通過一定的化學鍵或極性力來實現的，而細菌在物體表面的粘附是通過使用一種陰離子聚合物作為粘合劑來實現的。如果在納米指紋油中加入特殊的化合物，切斷附著在上面的化學鍵，使用低表面能的納米防指紋油，就可以達到防污的目的。